Simulations moléculaires et leur analyse

Abstract
Ce cours explique les concepts de la simulation moléculaire et son utilisation pour l'étude de la dynamique des macromolécules biologiques, telle qu'elle est étudiée par diffusion de neutrons. La complémentarité des deux techniques permet de comprendre des détails de la dynamique d'un système moléculaire complexe qui sont inaccessibles aux expériences seules. On peut ainsi mieux interpréter les données expérimentales et également développer des modèles physiques qui donnent une vue cohérente des observations. Ce dernier point est illustré par une étude du lysozyme en solution. En utilisant des méthodes provenant du traitement numérique du signal, on peut extraire des spectres de temps de relaxation qui illustrent que la dynamique des protéines est caractérisée par des processus de relaxation multi-échelles.