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Neutrons et Biologie
T. Ollivier, E. Farhi, M. Ferrand, M. Benoit
J. Phys. IV France 130 (2005) III-VDOI: 10.1051/jp4:2005130001
Avant-Propos
J. Ollivier, E. Farhi, M. Ferrand and M. Benoit Abstract
L'École Thématique "Neutrons et Biologie" s'est tenue du 22 au 26 Mai 2004 à
Praz/Arly (Haute-Savoie, France), dans le cadre des 12 èmes Journees de la Diffusion
Neutronique de la Societe Française de Neutronique. Cette école a ete organisee avec
le concours financier du CNRS (formation permanente), du Laboratoire Léon Brillouin
(CEA Saclay), de la region Rhône-Alpes, du conseil général de Haute-Savoie et de
l'Université Joseph Fourier de Grenoble. Une cinquantaine de participants, dont une
vingtaine d'intervenants, ont largement contribué à la réussite de l'École.
D'un point de vue scientifique, l'École s'est déclinée en sept sessions thématiques
majeures:
- une première session introductive a été consacrée à une revue globale des
méthodes biophysiques ayant un fort impact pour l'étude de la structure et de la
dynamique des macromolécules biologiques (J. Parello). Un accent tout particulier
à été apporté pour décrire les neutrons en tant que composante importante de
la panoplie des techniques couramment utilisées en biophysique moléculaire
(J. Schweitzer).
- une session dédiée aux mesures dynamiques par diffusion incohérente de neutrons
a été largement developpée. Qu'ils s'agissent de vibrations et de relaxations
moléculaires dans les protéines (J.M. Zanotti), de dynamique globale des protéines
(G. Zaccaï), ainsi que de dynamique de l'eau d'hydratation (F. Gabel), de nombreux
exemples ont permis d'illustrer la pertinence des neutrons pour étudier la dynamique
fonctionnelle des protéines sur l'échelle de temps picosecond nanoseconde.
L'analyse des données de diffusion inélastique de neutrons ne peut se passer de
modélisation théorique analytique des propriétés dynamique des biomolécules (D. Bicout).
- une large place avait été réservée aux études structurales en biologie. Cette
troisième session a rassemblé des contributions en diffusion aux petits angles
de neutrons pour l'étude structurale en solution (D. Lairez), en réflectométrie de
neutrons pour l'étude de systèmes des membranes ou de protéines en interaction avec des
membranes (G. Fragneto), ainsi qu'en diffraction de fibres appliquée à l'étude de l'ADN (T. Forsyth).
- les simulations de dynamique moléculaire constituent une méthode théorique unique pour étudier,
au niveau atomique, les mouvements internes des macromolécules biologiques, que ce soit à
l'équilibre (G. Kneller, S. Crouzy) ou hors équilibre (B. Gilquin). Les trajectoires de dynamique
moléculaire s'étendent aujourd'hui à la centaine de nanosecondes, et peuvent être de ce fait utilisées
par certains programmes pour calculer les observables expérimentales fournies par la diffusion
de neutrons (G. Kneller, T. Hinsen).
- l'ouverture des neutrons à des techniques instrumentales permettant d'approcher, d'une part,
des états hors-équilibre par le biais d'études cinétiques couplées à des mélanges rapides
pour des études de croissance de phases (I. Grillo) ou de repliement de protéines, d'autre part,
des conditions expérimentales extrèmes (hautes-pressions, M. Plazanet), nous ont semblé
constituer des émergences prometteuses. À ce titre, une revue sur le repliement des protéines (V. Forge)
a précisé l'importance de nombreuses techniques (fluorescence intrinsèque, dichroïsme, infra-rouge, RMN)
dans le domaine, tout en permettant d'entrevoir l'intérêt des études par neutrons.
- en marge des sessions purement "neutrons", il nous semblait important de pouvoir présenter
des techniques et méthodes souvent reconnues comme très complémentaires des neutrons, en privilégiant
un volet "études structurales" et un volet "études dynamiques". Côté méthodes dynamiques,
la RMN (M. Blackledge) a été positionnée comme une technique permettant d'étudier la flexibilité
moléculaire sur des echelles de temps plus lentes (ms). Côté méthodes structurales,
la bio-cristallographie des RX appliquée à l'études des structures virales (P. Gouet) a permis
de mettre en évidence des aspects complémentaires entre RX et neutrons, et de souligner les avantages
et inconvenients respectifs de ces techniques.
- l'École Thématique s'est achevée par une session commune avec les Journées Rossat-Mignod,
au cours de laquelle J. Helliwell a établi une revue comparative RX/neutrons sur les développements
récents en bio-cristallographie des protéines, suivi de deux presentations portant sur la dynamique
incohérente et cohérente de systèmes membranaires (F. Natali, M. Rheinstadter).
Contrairement aux années précédentes, le contenu de cet ouvrage se veut davantage refléter
les applications des neutrons en biologie et biophysique moléculaire, en se reportant à des
travaux scientifiques précis, plutôt que d'être constitué d'un recueil de cours, certes trés
pédagogiques, mais quelquefois trop éloignés de l'expérience. Nous espérons que ce choix saura
satisfaire le lecteur et encourager de nouveaux biologistes à utiliser les neutrons dès que
possible pour leurs systèmes d'intérêt.
Bonne lecture et bonnes manips !!!!
© EDP Sciences 2005